More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0816 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  47.55 
 
 		 290 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  44.41 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  46.88 
 
 		 290 aa  271  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  45.42 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  45.26 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  39.78 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  40.91 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  40.14 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  41.94 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  36.12 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  40.83 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  40.94 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  39.38 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  39.41 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  36.09 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  37.54 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  35.85 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  34.81 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  36.99 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.01 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  34.15 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  32.67 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  35.86 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.43 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.76 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.86 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.02 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  35.22 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.39 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  29.56 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.8 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.13 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.82 
 
 		 514 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  29.2 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  28.34 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.8 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  28.48 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.48 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.48 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  28.48 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.16 
 
 		 316 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  30.31 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  41.67 
 
 		 469 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.72 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.12 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.33 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.33 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  29.92 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.25 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  35.43 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  29.6 
 
 		 506 aa  123  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  31.18 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  23.59 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  31.18 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  32.8 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  33.18 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.35 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.08 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  31.09 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  33.74 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.62 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>