More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0776 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  100 
 
 		 395 aa  799    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  31.3 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  27.73 
 
 		 615 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.16 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.65 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  32.31 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.74 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.47 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.93 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.72 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.25 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.2 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.15 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.76 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  33.33 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 969 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.42 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.2 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.75 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.1 
 
 		 717 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.72 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  28.4 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.25 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  27.85 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  27.91 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  27.85 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.24 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  26.04 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.85 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.04 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  26.56 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  29.61 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  29.35 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.67 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.43 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  25.95 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  27.73 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.88 
 
 		 1609 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.82 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.24 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.12 
 
 		 656 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.1 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  33.33 
 
 		 944 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.39 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 646 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  28.14 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  28.91 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.39 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.71 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  26.36 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.68 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  25 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.09 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.86 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.87 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.87 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  25.27 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  26.74 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.89 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  24.91 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.67 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.22 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  26.04 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.66 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.1 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.78 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.19 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  24.8 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  24.25 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  30.18 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  24.61 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  32.89 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  26.07 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  24.71 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.84 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.39 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.74 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.09 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  28 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.88 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 642 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  29.25 
 
 		 1067 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.48 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  25.78 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.49 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>