More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0770 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  100 
 
 		 931 aa  1916    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  56.26 
 
 		 935 aa  1046    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  63.2 
 
 		 938 aa  1227    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  62.12 
 
 		 931 aa  1181    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  61.91 
 
 		 942 aa  1186    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  47.92 
 
 		 743 aa  635    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 744 aa  680    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  45.54 
 
 		 771 aa  626  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  47.51 
 
 		 844 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  47.11 
 
 		 863 aa  600  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  44.89 
 
 		 843 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  46.1 
 
 		 827 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.34 
 
 		 864 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.59 
 
 		 702 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  43.28 
 
 		 747 aa  521  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  40.33 
 
 		 849 aa  501  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  40.2 
 
 		 837 aa  501  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.22 
 
 		 837 aa  481  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  39.47 
 
 		 834 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.58 
 
 		 780 aa  349  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  32.59 
 
 		 855 aa  335  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.94 
 
 		 610 aa  299  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  33.03 
 
 		 853 aa  298  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  31.7 
 
 		 812 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  31.71 
 
 		 814 aa  294  6e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  31.54 
 
 		 814 aa  294  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  31.32 
 
 		 817 aa  293  9e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.61 
 
 		 631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.95 
 
 		 604 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  33 
 
 		 604 aa  278  5e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  33.95 
 
 		 596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  33.45 
 
 		 602 aa  270  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 691 aa  253  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 668 aa  249  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  30.98 
 
 		 868 aa  245  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  30.23 
 
 		 863 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  29.9 
 
 		 828 aa  240  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  27.71 
 
 		 694 aa  234  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  28.12 
 
 		 616 aa  232  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  32.64 
 
 		 857 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 751 aa  226  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.18 
 
 		 689 aa  225  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  27.97 
 
 		 693 aa  225  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  27.36 
 
 		 684 aa  223  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  31.27 
 
 		 768 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 693 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 694 aa  220  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 708 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 868 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 700 aa  218  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  27.62 
 
 		 673 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  29.6 
 
 		 793 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 700 aa  215  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.09 
 
 		 836 aa  214  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 756 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 859 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 697 aa  211  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  29.83 
 
 		 697 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 869 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 869 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 869 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 869 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  30.43 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 746 aa  210  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  26.29 
 
 		 702 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 868 aa  210  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 702 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 872 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 693 aa  208  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  28.06 
 
 		 629 aa  208  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 779 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.88 
 
 		 868 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  27.2 
 
 		 694 aa  207  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  31.39 
 
 		 849 aa  207  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  28.73 
 
 		 768 aa  207  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 		 758 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 759 aa  206  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 779 aa  206  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  28.25 
 
 		 867 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  28.22 
 
 		 759 aa  204  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  30.04 
 
 		 815 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  28.74 
 
 		 876 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  28.61 
 
 		 679 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  28.12 
 
 		 684 aa  204  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  27.47 
 
 		 669 aa  204  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  27.87 
 
 		 757 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.2 
 
 		 695 aa  204  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 906 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  26.58 
 
 		 696 aa  203  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  26.43 
 
 		 700 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  29.87 
 
 		 869 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>