More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0717 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
217 aa  421  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.79 
 
 
216 aa  297  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.51 
 
 
216 aa  244  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  54.46 
 
 
219 aa  224  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  36.19 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.92 
 
 
218 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  39.79 
 
 
212 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.41 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.41 
 
 
211 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.06 
 
 
211 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.73 
 
 
214 aa  121  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.9 
 
 
217 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.54 
 
 
207 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.8 
 
 
231 aa  121  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  37.82 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.3 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.27 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0603  multiple antibiotic resistance MarC-related protein  36.89 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.86 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  38.46 
 
 
209 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  36.79 
 
 
207 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 
219 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  37.63 
 
 
212 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.16 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.45 
 
 
212 aa  118  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  38.46 
 
 
209 aa  118  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  35.86 
 
 
214 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.31 
 
 
206 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  36.55 
 
 
214 aa  118  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  35.86 
 
 
214 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 
206 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  117  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  34.36 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  36.79 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  35.75 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.89 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.9732  normal  0.188603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  31.86 
 
 
206 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 
206 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 
206 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.82 
 
 
206 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.41 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.27 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  37.38 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.89 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.89 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.59 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.8 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.08 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  38.86 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.19 
 
 
213 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.5 
 
 
206 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.22 
 
 
209 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  34.98 
 
 
207 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 
206 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0571  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.21 
 
 
214 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 
214 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 
212 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.19 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.2 
 
 
206 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.73 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  34.85 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.44 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  34.85 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  34.69 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.25 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.96 
 
 
204 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.67 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.89 
 
 
215 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.14 
 
 
210 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.41 
 
 
205 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.72 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.12 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  35.12 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.59 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>