25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0630 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0630  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00298214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2139  methanogenesis marker protein 11  64.31 
 
 
297 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0431917  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0595  hypothetical protein  65.1 
 
 
298 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.183466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1804  hypothetical protein  64.04 
 
 
296 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0229  hypothetical protein  63.32 
 
 
295 aa  362  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0403  hypothetical protein  49.47 
 
 
303 aa  254  8e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000299403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0536  hypothetical protein  44.56 
 
 
302 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2301  hypothetical protein  40.14 
 
 
303 aa  208  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1486  hypothetical protein  37.5 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0905  hypothetical protein  37.46 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0840  hypothetical protein  36.52 
 
 
301 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.156191  normal  0.850594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1816  hypothetical protein  37.1 
 
 
301 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1077  methanogenesis marker protein 11  37.32 
 
 
301 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0629  hypothetical protein  31.25 
 
 
318 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2138  hypothetical protein  29.33 
 
 
318 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00938098  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0236  hypothetical protein  32.29 
 
 
318 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0594  hypothetical protein  30.67 
 
 
338 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.184211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1355  hypothetical protein  29.39 
 
 
368 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0680221  normal  0.056831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0972  hypothetical protein  30.69 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0102178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2291  hypothetical protein  24.38 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0480  ribosomal protein L15-like protein  26.05 
 
 
375 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.774721  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1562  hypothetical protein  21.09 
 
 
450 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3498  hypothetical protein  28.74 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2547  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.61 
 
 
425 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1994  hypothetical protein  26.07 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.183583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>