More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0568 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  78.52 
 
 		 139 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  73.72 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  70.8 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  62.04 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  61.31 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  53.28 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  54.74 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  53.97 
 
 		 151 aa  149  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  52.71 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  52.94 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  55.04 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  54.55 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  55.15 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  52.21 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  44.83 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  43.8 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  42.36 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  42.36 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  43.06 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  42.34 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  44.85 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  45.59 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  43.41 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  44.12 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  44.12 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  45.52 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  37.04 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  41.86 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  37.04 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  41.26 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  40.41 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  39.29 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  42.67 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  40.26 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  41.1 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  46.03 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  41.43 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  44.12 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  40.62 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  39.68 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  47.27 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  42.47 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  48.15 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0481  ribosomal protein S19  41.03 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  41.43 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  40 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0300  ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.373495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  40.62 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  48.15 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  43.86 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  49.06 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  38.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  39.44 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  49.06 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  40.58 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  47.17 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  43.28 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  44.78 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  37.68 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  40.98 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  47.17 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0393  30S ribosomal protein S19  35.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  47.17 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05735  30S ribosomal protein S19  37.18 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  42.62 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  42.62 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  39.68 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  45.28 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  39.13 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  46.3 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  39.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  39.13 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0230  30S ribosomal protein S19  44.64 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.17899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  39.13 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  39.13 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  41.51 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  40.3 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  39.13 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  43.55 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  43.28 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  43.55 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  43.4 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  41.51 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  41.79 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>