288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0564 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 337 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  69.73 
 
 		 337 aa  512  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  69.73 
 
 		 337 aa  502  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  67.06 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  64.16 
 
 		 333 aa  447  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  56.68 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  57.86 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  53.39 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  53.53 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  50.74 
 
 		 338 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  50.44 
 
 		 338 aa  347  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  56.51 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  49.42 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  48.96 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 		 334 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  48.66 
 
 		 334 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  48.37 
 
 		 334 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  45.7 
 
 		 334 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  44.38 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  43.2 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  44.59 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  43.52 
 
 		 347 aa  252  5.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  43.49 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  39.94 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  38.77 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  38.71 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.32 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  34.24 
 
 		 390 aa  185  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  35.48 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.09 
 
 		 392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  34.42 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  27.8 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  29.23 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  28.98 
 
 		 220 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  29.33 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  28.52 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  29.33 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  29.33 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  27.82 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  26.18 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  30.22 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  28.83 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  28.37 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  27.11 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  27.08 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  28.67 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  28.92 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  27.82 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  26.86 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  28.01 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  27.56 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  27.21 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  27.34 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  26.41 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  34.25 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  25.61 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  25.36 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  24.73 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  25.8 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  27.11 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  26.98 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  25 
 
 		 209 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  25.72 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  26.26 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  27.6 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  24.46 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  31.11 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  26.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  30.54 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  25.63 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  26.18 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  23.45 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  28.66 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  26.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  26.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  27.4 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  26.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  26.67 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  31.2 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  26.98 
 
 		 212 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  26.15 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  23.76 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  27.02 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  24.03 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  26.45 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  25.72 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  27.92 
 
 		 218 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  26.26 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  25.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  24.91 
 
 		 208 aa  52.8  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  24.19 
 
 		 209 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  23.49 
 
 		 212 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  34.68 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>