More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0505 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  76.02 
 
 		 222 aa  330  9e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  64.81 
 
 		 218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  39.53 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  41.4 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  38.5 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  33.67 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 132 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.77 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  31.94 
 
 		 444 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  23.85 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  24.09 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 		 450 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  26.07 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.77 
 
 		 445 aa  82  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  26.06 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  26.89 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  26.19 
 
 		 443 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 444 aa  79  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 449 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  31.11 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.57 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  23.37 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.72 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  25.47 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  25.94 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  27.04 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.44 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.66 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  26.53 
 
 		 458 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  40.35 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  28.38 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.76 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  25.59 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  25.12 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  26.23 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  26.23 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  26.23 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  27.75 
 
 		 449 aa  71.6  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  31.73 
 
 		 443 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 		 492 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 437 aa  71.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  26.37 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  26.07 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  29.21 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  29.59 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  32.2 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  28.45 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  29 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>