More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0493 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  66.96 
 
 		 234 aa  320  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  62.27 
 
 		 223 aa  304  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  66.06 
 
 		 222 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  62.27 
 
 		 232 aa  299  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  62.22 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  60.54 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  56.25 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  57.73 
 
 		 223 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  56.95 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  55.61 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  56.36 
 
 		 227 aa  272  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  53.15 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.14 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.67 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  51.14 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50.23 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  49.33 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  52.34 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50.22 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.88 
 
 		 653 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.95 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.32 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50.89 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.61 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.68 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.93 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47.06 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 		 408 aa  218  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  52.66 
 
 		 654 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  47.49 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.98 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  46.36 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.9 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.77 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.27 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  46.88 
 
 		 644 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.77 
 
 		 230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.21 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.66 
 
 		 247 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  47.98 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.7 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 277 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.4 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.03 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.64 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.42 
 
 		 241 aa  213  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.08 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  49.11 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.12 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  49.11 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  49.11 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.49 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.54 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.54 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.66 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.32 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  49.55 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.49 
 
 		 252 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.37 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  46.64 
 
 		 653 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  48.83 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.96 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  46.88 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  49.35 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.64 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>