More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0403 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 1050 aa  951    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 1040 aa  795    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 1053 aa  773    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 1068 aa  923    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 1070 aa  914    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 		 1060 aa  1452    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 1033 aa  791    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 1058 aa  1192    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 1068 aa  932    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1059 aa  2173    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 1062 aa  1478    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 1034 aa  785    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 1058 aa  1165    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 1039 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 1039 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 1034 aa  767    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 1034 aa  785    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 1066 aa  738    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 1049 aa  1184    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 1062 aa  851    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 1076 aa  1468    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 1089 aa  894    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 1066 aa  1397    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 		 1033 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 1049 aa  623  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 1042 aa  623  1e-177  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 1033 aa  622  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 1033 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 975 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 1033 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 1033 aa  618  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 1033 aa  619  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 977 aa  616  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 1033 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 1033 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 1033 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 1033 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 1046 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 1059 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 1024 aa  613  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 980 aa  612  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 1037 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 977 aa  602  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 977 aa  601  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 1068 aa  598  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 1060 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 1091 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 1050 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 1100 aa  578  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 1077 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 1083 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 991 aa  571  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 1031 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 1075 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 1054 aa  572  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 1049 aa  572  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 1066 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 1014 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 1048 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 1014 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 1079 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 1066 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 1086 aa  562  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 1014 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 1036 aa  557  1e-157  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 1089 aa  558  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 1081 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 1061 aa  559  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 1073 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 1056 aa  551  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 1085 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 1080 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 1080 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 1069 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 1069 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 1084 aa  538  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 1082 aa  538  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 929 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 1108 aa  533  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00705  isoleucyl-tRNA synthetase ,cytoplasmic (AFU_orthologue; AFUA_1G13710)  32.25 
 
 		 1077 aa  530  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 1110 aa  526  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 919 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 1129 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  33.3 
 
 		 1051 aa  515  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 919 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 1133 aa  516  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 927 aa  513  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 1134 aa  516  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 920 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 939 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 922 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3498  isoleucyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 1085 aa  509  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 1135 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 1037 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 926 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 929 aa  506  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11569  isoleucyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 1041 aa  502  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27300  isoleucyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 1060 aa  503  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.712864  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 931 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>