More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0400 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  100 
 
 
378 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  61.88 
 
 
384 aa  486  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  61.27 
 
 
378 aa  479  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  63.3 
 
 
377 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  62.5 
 
 
377 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  42.75 
 
 
393 aa  290  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  43.65 
 
 
395 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  42.9 
 
 
394 aa  277  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  39.71 
 
 
415 aa  275  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  40.63 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  43.12 
 
 
412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  41.07 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  41.05 
 
 
366 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  38.73 
 
 
380 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  38.85 
 
 
386 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  32.89 
 
 
342 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  40.33 
 
 
373 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  34.3 
 
 
338 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  32.63 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  35.98 
 
 
375 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  35.56 
 
 
370 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  36.27 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  37.3 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  36.83 
 
 
343 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  32.57 
 
 
380 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  32.32 
 
 
380 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  33.6 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  37.13 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  32.89 
 
 
373 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  34.31 
 
 
372 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  31.12 
 
 
379 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  29.17 
 
 
370 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  36.57 
 
 
388 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  36.89 
 
 
377 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  40.08 
 
 
239 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  31.5 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  31.52 
 
 
373 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  30.71 
 
 
381 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  31.1 
 
 
404 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  32.2 
 
 
373 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  31.62 
 
 
364 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  29.95 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  30.48 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  33.25 
 
 
372 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  29.05 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  31.25 
 
 
385 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  30.73 
 
 
366 aa  136  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  31.44 
 
 
393 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  34.13 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  30.39 
 
 
365 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  26.72 
 
 
370 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  31.58 
 
 
394 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.46 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.98 
 
 
405 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  27.27 
 
 
371 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  31.71 
 
 
373 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  27.89 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  28.64 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  31.73 
 
 
396 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.67 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  27.85 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  27.85 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  32.59 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  25.32 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  29.17 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.39 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  26.67 
 
 
417 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  26.67 
 
 
417 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  27.63 
 
 
431 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  27.9 
 
 
381 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  30.65 
 
 
374 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  27.62 
 
 
403 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  30.28 
 
 
424 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  40.1 
 
 
362 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  24.49 
 
 
413 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  26.34 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  25.77 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  28.72 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  27.84 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  26.15 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  31.19 
 
 
301 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  33.87 
 
 
258 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.16 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  28.24 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.13 
 
 
612 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.07 
 
 
285 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  35.71 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  38.46 
 
 
383 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  30.45 
 
 
292 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  36.26 
 
 
293 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  34.97 
 
 
286 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.76 
 
 
580 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  37.4 
 
 
875 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
769 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  29.57 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  33.33 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  37.61 
 
 
859 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  39.84 
 
 
867 aa  84.3  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  37.4 
 
 
879 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>