More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0395 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  62.16 
 
 
295 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  57.97 
 
 
293 aa  358  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  60.34 
 
 
296 aa  348  9e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  44.37 
 
 
298 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  44.37 
 
 
306 aa  245  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  50 
 
 
332 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
341 aa  232  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
251 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
274 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.15 
 
 
236 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.99 
 
 
308 aa  182  6e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.48 
 
 
243 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
240 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.23 
 
 
310 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.62 
 
 
243 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  40.18 
 
 
305 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  40.25 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.59 
 
 
241 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
253 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  33.92 
 
 
304 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  40.08 
 
 
246 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  40 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  33.45 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
248 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.73 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.78 
 
 
338 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 
320 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  39.11 
 
 
244 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.21 
 
 
305 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.72 
 
 
303 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.96 
 
 
321 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.68 
 
 
312 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.64 
 
 
308 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  34.87 
 
 
247 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.09 
 
 
325 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.78 
 
 
299 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  38.39 
 
 
244 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  35.25 
 
 
305 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.86 
 
 
303 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  33.33 
 
 
309 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.33 
 
 
246 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  36.8 
 
 
235 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.05 
 
 
339 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.78 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
312 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
305 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  41.23 
 
 
311 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.36 
 
 
313 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  39.18 
 
 
328 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  39.56 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.45 
 
 
311 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.93 
 
 
313 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  37.08 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  34.87 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  36.89 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  36.77 
 
 
583 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  35.92 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.11 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.91 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.75 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  32.88 
 
 
326 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.4 
 
 
315 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
311 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  31.4 
 
 
294 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.99 
 
 
305 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.64 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  36.91 
 
 
244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.77 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  31.4 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  35.48 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  38.24 
 
 
308 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.87 
 
 
331 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.74 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  39.09 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.19 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  31.4 
 
 
294 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.22 
 
 
306 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  36.67 
 
 
334 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  37.1 
 
 
344 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.48 
 
 
309 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  31.97 
 
 
303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  37.73 
 
 
578 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
578 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.26 
 
 
319 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 
294 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
578 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>