More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0380 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 360 aa  716    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  50.28 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  49.15 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 365 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  48.73 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  48.14 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  38.31 
 
 		 364 aa  258  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  45.75 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  39.78 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  46.18 
 
 		 402 aa  252  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  43.21 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  39.6 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  43.57 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.3 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.3 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 445 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.97 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.32 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  44.51 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  45.77 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  36.81 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.44 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  43.95 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 410 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.77 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  37.64 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  37.64 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  38.66 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.41 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  42.37 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  42.36 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.73 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.13 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.19 
 
 		 476 aa  236  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.7 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  45.16 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  37.54 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  38.2 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  37.39 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  36.95 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  42.86 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  41.16 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  35.49 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.35 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  35.59 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  37.39 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.98 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  42.46 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0629  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  43.61 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  42.32 
 
 		 449 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.23 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.13 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  40.92 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 		 356 aa  229  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.35 
 
 		 419 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.71 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.84 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  35.31 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  37.76 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  39.43 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  38.07 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.18 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  40.5 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  35.47 
 
 		 412 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.79 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.12 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  37.97 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 		 385 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.65 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  34.93 
 
 		 412 aa  225  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2776  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285612  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.3 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  44.35 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>