More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0327 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 		 249 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  74.19 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  71.77 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  75.4 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  73.39 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  72.36 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  50.2 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  46.31 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  49.53 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.14 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.13 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.5 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  44.71 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  38.31 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.69 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.11 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.57 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.18 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  44.71 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.98 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.46 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  40 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  69.64 
 
 		 126 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  43.13 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  38.29 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  41.83 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  37.25 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.4 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  35.09 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  31.8 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 		 287 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  34.63 
 
 		 665 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  29.22 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  25.94 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.06 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  31.6 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 260 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 297 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.03 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.75 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 290 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 292 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  26.34 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.54 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 290 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 280 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.7 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 278 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>