More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0256 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 349 aa  697    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  57.18 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  54.05 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  46.11 
 
 		 347 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  54.05 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  42.77 
 
 		 353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  43.06 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  42.49 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  39.77 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.51 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  41.19 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  41.29 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  41.29 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  44.91 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.09 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  42.09 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  48.05 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  44.76 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  40.73 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  40.73 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  39.44 
 
 		 403 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  40.45 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  44.33 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  39.19 
 
 		 348 aa  228  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  38.44 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  38.14 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.91 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  37.22 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.22 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  43.36 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  35.8 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  44.8 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  37.76 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.7 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  44.44 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  40.88 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.9 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.23 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  41.67 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  44.44 
 
 		 632 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.27 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.31 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41 
 
 		 380 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 367 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  37.13 
 
 		 362 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  43.64 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.88 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  35.12 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  38.84 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.35 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  41.99 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  40.56 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  44.01 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  38.98 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  41.09 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  39.37 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  40.28 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  46.15 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.37 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  42.91 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  37.28 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.64 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.54 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  41.82 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  42.96 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.11 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.31 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  40 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  40.21 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43.48 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  40.26 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>