More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0228 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  67.44 
 
 
476 aa  676    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  68.16 
 
 
470 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
478 aa  977    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  62.47 
 
 
629 aa  609  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0202  amidophosphoribosyltransferase  58.41 
 
 
467 aa  545  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.19118  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0150  hypothetical protein  55.88 
 
 
462 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0365375  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
463 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
477 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
462 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  52.13 
 
 
479 aa  496  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1477  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
499 aa  484  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  51.42 
 
 
475 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  52.32 
 
 
469 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
480 aa  475  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2658  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
490 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
503 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  50.78 
 
 
478 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
459 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  48.36 
 
 
456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
465 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
459 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  47.66 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  47.01 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
472 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
467 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
477 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  47.87 
 
 
466 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
474 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
472 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
487 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
477 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  44.49 
 
 
462 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
472 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.79 
 
 
475 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  46.23 
 
 
500 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
465 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  44.4 
 
 
461 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  45.71 
 
 
470 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
462 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
472 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 
475 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
466 aa  413  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  46.37 
 
 
468 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
473 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 
481 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
473 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
473 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
474 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
471 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
494 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
493 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  45.92 
 
 
470 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  46.37 
 
 
482 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
494 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
471 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
492 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  44.35 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  44.54 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  47.91 
 
 
484 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
515 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
499 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
471 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
488 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  43.49 
 
 
482 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
534 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
488 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  45.37 
 
 
503 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
466 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  44.42 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
515 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  43.72 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  45.2 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  45.92 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>