25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0170 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0170  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 95 aa  190  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1392  DNA polymerase beta subunit  53.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.206077  normal  0.55899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  27.38 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  32.1 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  42.86 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  44.68 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  38.82 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0500  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2746  DNA polymerase beta domain protein region  39.68 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  29.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0606  DNA polymerase beta domain protein region  26.88 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000675523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0083  hypothetical protein  31.71 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  31.63 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  40.74 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  30.59 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>