More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0152 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  100 
 
 		 160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  58.49 
 
 		 161 aa  197  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  58.06 
 
 		 158 aa  187  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  48.73 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  43.79 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  34.67 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  34 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  32.67 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.92 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.75 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  37.11 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 348 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  34.18 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  33.77 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.5 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  32.03 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.05 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  32.89 
 
 		 220 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  32.05 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.42 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.75 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  32.89 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  32.5 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  32.45 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.17 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  33.12 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.69 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.84 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 233 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.92 
 
 		 258 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.09 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  30.2 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.94 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.26 
 
 		 598 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 338 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.9 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  31.45 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.25 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  33.54 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.61 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 410 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  30.72 
 
 		 313 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  28.48 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  32.91 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  31.37 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.26 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.12 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.26 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  28.57 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  32.43 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.24 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.17 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  31.13 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.76 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.17 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  28.66 
 
 		 315 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28.75 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  31.94 
 
 		 333 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  33.97 
 
 		 196 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 315 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.45 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  29.56 
 
 		 417 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.46 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  27.1 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  24.68 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.77 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  30.52 
 
 		 339 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  29.73 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.58 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  30 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>