75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0135 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 397 aa  819    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.6 
 
 		 283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.76 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.94 
 
 		 279 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.2 
 
 		 273 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.47 
 
 		 152 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.63 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.9 
 
 		 176 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  35.63 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.61 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.63 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.84 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.63 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.2 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0424  hypothetical protein  28.43 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.69 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.64 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  38.03 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 138 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.29 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.47 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.84 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  26 
 
 		 146 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.03 
 
 		 251 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.03 
 
 		 251 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.56 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  28.3 
 
 		 140 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.41 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.02 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.8 
 
 		 278 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  27.17 
 
 		 134 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.38 
 
 		 154 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.25 
 
 		 138 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.09 
 
 		 134 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.69 
 
 		 204 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.25 
 
 		 138 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.25 
 
 		 138 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.56 
 
 		 140 aa  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  30.09 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.09 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.09 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25 
 
 		 134 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.04 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.3 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  27.16 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  26.09 
 
 		 143 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.44 
 
 		 137 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  26.09 
 
 		 135 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.36 
 
 		 137 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  27.59 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.93 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.68 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  26.27 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.68 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 		 126 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  25.47 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.36 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  30.86 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.2 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.59 
 
 		 151 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.19 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.7 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 		 139 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  36.99 
 
 		 137 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.67 
 
 		 226 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.57 
 
 		 144 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>