19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0106 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0106  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2739  transcriptional regulator, XRE family  59.01 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1154  transcriptional regulator, XRE family  58.39 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.501074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0501  XRE family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2112  helix-turn-helix domain-containing protein  56.52 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0071  XRE family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2130  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.120661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1033  XRE family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1633  XRE family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0808  hypothetical protein  37.18 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1289  hypothetical protein  35.67 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0743  hypothetical protein  35.26 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0078  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1175  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0738  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0931337  normal  0.163713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 528 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0958  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 80 aa  40.8  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>