25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0063 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  750    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  62.97 
 
 
379 aa  425  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  44.44 
 
 
386 aa  316  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  40.93 
 
 
415 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  42.78 
 
 
430 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  42.9 
 
 
483 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  36.45 
 
 
459 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  37.92 
 
 
455 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  37.31 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  36.18 
 
 
422 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  32.64 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  32.33 
 
 
463 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  31.8 
 
 
459 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  40.41 
 
 
328 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  26.06 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0683  hypothetical protein  29.72 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.383867  normal  0.499356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  25.39 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0680  hypothetical protein  28.95 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  32.26 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  24.65 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  30.23 
 
 
505 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  27.4 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  28.21 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0760  S-layer-like domain-containing protein  26.45 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0390726  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  24.64 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>