264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0048 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 367 aa  753    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  69.03 
 
 		 362 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  69.89 
 
 		 362 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  67.86 
 
 		 365 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  65.45 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  56.63 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  58.24 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  53.07 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  50.84 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  49.32 
 
 		 800 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  48.52 
 
 		 856 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  46.26 
 
 		 859 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  46.26 
 
 		 859 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  46.59 
 
 		 792 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  41.08 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  46.26 
 
 		 859 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  42.86 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.9 
 
 		 863 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  41.26 
 
 		 359 aa  305  7e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  44.05 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  45.43 
 
 		 859 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  45.43 
 
 		 859 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.09 
 
 		 944 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  43.37 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  44.09 
 
 		 899 aa  293  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  44.02 
 
 		 842 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.59 
 
 		 841 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  43.35 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  44.51 
 
 		 820 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  40.66 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 826 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 		 859 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  43.97 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 		 418 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.82 
 
 		 881 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  42.15 
 
 		 841 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  43.93 
 
 		 857 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  45.51 
 
 		 779 aa  279  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  41.32 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  42.37 
 
 		 871 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.15 
 
 		 852 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  40.87 
 
 		 867 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.24 
 
 		 836 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.06 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.86 
 
 		 872 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.36 
 
 		 875 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  43.47 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  38.4 
 
 		 358 aa  269  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  44.06 
 
 		 860 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  41.86 
 
 		 356 aa  269  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  43.8 
 
 		 838 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 361 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.45 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  40.91 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  40.44 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  41.03 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  42.5 
 
 		 757 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.72 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.31 
 
 		 884 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.41 
 
 		 737 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.41 
 
 		 741 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.79 
 
 		 737 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.78 
 
 		 382 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  38.42 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  39.28 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.04 
 
 		 384 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  38.04 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2637  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 459 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  43.61 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0645  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 		 459 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 372 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 		 358 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  40.34 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  39.44 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  36.03 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  38.73 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1418  FO synthase subunit 2  39.51 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2018  FO synthase subunit 2  39.39 
 
 		 482 aa  242  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.595846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  39.62 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  36.88 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1308  FO synthase subunit 2  41.18 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  37.03 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  37.85 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>