More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0037 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0037  ribonuclease III  100 
 
 		 156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1116  ribonuclease III  61.27 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1315  hypothetical protein  52.67 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2224  ribonuclease III  52.82 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0167185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0304  ribonuclease III  42.4 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.821127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  36.62 
 
 		 263 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  36.96 
 
 		 409 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  36.96 
 
 		 409 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  36.96 
 
 		 409 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  36.96 
 
 		 256 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  35.46 
 
 		 425 aa  87.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  36.96 
 
 		 467 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  35.46 
 
 		 425 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  36.23 
 
 		 408 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  36.23 
 
 		 256 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  36.23 
 
 		 469 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  36.23 
 
 		 406 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  36.23 
 
 		 256 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  36.96 
 
 		 418 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  36.23 
 
 		 441 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  34.51 
 
 		 263 aa  84.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  35.51 
 
 		 256 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  36.23 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  36.23 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1493  ribonuclease III  37.12 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000322958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  37.68 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  34.78 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  35.25 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0608  ribonuclease III  37.86 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.815667  normal  0.533927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  36.6 
 
 		 246 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  38.93 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.25 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  36.23 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  37.4 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  36.23 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  30.53 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  33.33 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  32.47 
 
 		 246 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  33.58 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  33.58 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  34.06 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  33.77 
 
 		 233 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  37.4 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  33.58 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  30.37 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  34.53 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  36.88 
 
 		 222 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.69 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  36.64 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  33.09 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  36.62 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  33.11 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  35.88 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  36.64 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  33.06 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  36.64 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  34.81 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  32.62 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  32.82 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  35.57 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  32.62 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  35.71 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  36.8 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  32.17 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  29.53 
 
 		 258 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3238  ribonuclease III  32.93 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.257375  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  32.17 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  32.59 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  33.85 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  35.16 
 
 		 276 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  35.51 
 
 		 271 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  29.93 
 
 		 236 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  31.47 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  31.47 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  32.17 
 
 		 245 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  31.47 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  36.91 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  31.47 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  34.04 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  32.84 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  30.22 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  34.35 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  28.89 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.62 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  31.54 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  35.66 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  31.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  35.57 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  33.33 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>