More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0032 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  100 
 
 
288 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  50.7 
 
 
284 aa  316  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  51.93 
 
 
289 aa  308  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  55.47 
 
 
267 aa  305  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  44.91 
 
 
284 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  38.65 
 
 
299 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  34.72 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  33.22 
 
 
323 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  34.78 
 
 
286 aa  158  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  34.92 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.07 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.34 
 
 
275 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  35.71 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  29.64 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.31 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  32.69 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.46 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.11 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  29.65 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  23.46 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  33.18 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  29.07 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  25 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  27.39 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  28.31 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.5 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  28.39 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  23.94 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.37 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.31 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.43 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  30.9 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  25.21 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  32.17 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  25.94 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.79 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.21 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  26.4 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  28.78 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  25.17 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.17 
 
 
352 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  31.93 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  29.65 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25.17 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  28.09 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  25.75 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  25.85 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.5 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  27.59 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.18 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  26.14 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  29.58 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
254 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  40 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  39.19 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  39.19 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  34.94 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  28.91 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  51.67 
 
 
581 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.08 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  27.46 
 
 
232 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
276 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  46.3 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.14 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.91 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.9 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0959  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.4 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  42.35 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0897  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.02 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>