40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0031 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  54.41 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  50.55 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  50.18 
 
 
300 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  46.67 
 
 
275 aa  259  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  49.08 
 
 
277 aa  259  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  45.76 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  47.37 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  29.03 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  29.57 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  30.31 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  32.06 
 
 
296 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.38 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  30.68 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  30.77 
 
 
251 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  33.52 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  32.99 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  29.73 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  26.64 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  31.25 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  25.1 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  31.65 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  27.72 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  30.32 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  26.82 
 
 
281 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  29.34 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.85 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.85 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  31.46 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  34.19 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  26 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  21.43 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  29.79 
 
 
254 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  23.19 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  20.72 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  31.18 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  35.53 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  26.32 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  24.62 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>