More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0013 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  73.5 
 
 
120 aa  167  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  54.29 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  53.47 
 
 
128 aa  103  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.21 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  44.16 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  48.53 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.58 
 
 
336 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  32.74 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
317 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  38.96 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  46.88 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  38.89 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.95 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  35.8 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  38.46 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  42.65 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  38.75 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
347 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  39.71 
 
 
306 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
349 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  42.19 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>