More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0012 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0012  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  66.44 
 
 
300 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2083  permease  45.24 
 
 
301 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  32.33 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.89 
 
 
307 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  31.99 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.62 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  31.82 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  30.34 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  31.29 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  31.82 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  31.06 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.83 
 
 
2798 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  34.47 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.21 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.11 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.92 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  24.9 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  27.11 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.27 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  28.51 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  30.5 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  27.56 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  27.56 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.99 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.31 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.56 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.34 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.34 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  31.22 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  26.79 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.7 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.22 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  26.07 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  27.8 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  28.28 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.8 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  29.13 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  29.13 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.8 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.91 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.8 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  29.26 
 
 
272 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.27 
 
 
262 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  26.38 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.04 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  30.92 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.03 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29.24 
 
 
255 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.39 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.25 
 
 
263 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.39 
 
 
266 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  31.77 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.85 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27.68 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.14 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.84 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  26.55 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.84 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  28.89 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  27.47 
 
 
354 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.04 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  27.08 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.67 
 
 
273 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.66 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  28 
 
 
274 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  25.43 
 
 
266 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.49 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.26 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  37.4 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1176  hypothetical protein  28.23 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.463747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  26.74 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  29.01 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  29.6 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  31.13 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  25.88 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  29.1 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  23.02 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  29.28 
 
 
266 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.08 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  28.39 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  25.28 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  28.81 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>