More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0003 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
386 aa  793    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  67.27 
 
 
385 aa  550  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  65.54 
 
 
388 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  67.19 
 
 
400 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  64.08 
 
 
387 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.91 
 
 
390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  55.15 
 
 
391 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  57.14 
 
 
396 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  56.05 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  57.4 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  53.75 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  55.91 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  54.71 
 
 
397 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  53.79 
 
 
393 aa  431  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  54.74 
 
 
401 aa  428  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  54.95 
 
 
405 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  52.11 
 
 
390 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  51.68 
 
 
396 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  51.94 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  51.94 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  51.94 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  51.94 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  51.68 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  55.12 
 
 
390 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  51.94 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  51.68 
 
 
396 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
387 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  51.68 
 
 
396 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  50.39 
 
 
396 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
387 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  51.16 
 
 
396 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  52.12 
 
 
388 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  51.31 
 
 
392 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  51.31 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  51.3 
 
 
386 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 
391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 
386 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
395 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 
398 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  49.35 
 
 
398 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  48.95 
 
 
402 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  51.55 
 
 
410 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  49.09 
 
 
398 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  51.06 
 
 
385 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  51.44 
 
 
387 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  50.79 
 
 
386 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  50 
 
 
381 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  52.49 
 
 
388 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 
383 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
393 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  47 
 
 
388 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
385 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  47.35 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 
380 aa  349  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  42.15 
 
 
387 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  42.15 
 
 
387 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  42.15 
 
 
387 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  41.88 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  41.88 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  41.88 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  41.62 
 
 
385 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  41.62 
 
 
387 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  41.36 
 
 
387 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  41.62 
 
 
387 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  41.1 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  47.18 
 
 
367 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  43.5 
 
 
370 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  41.41 
 
 
386 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  41.91 
 
 
380 aa  292  7e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  42.34 
 
 
379 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  43.42 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  39.37 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  40.21 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 
380 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  36.46 
 
 
398 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.22 
 
 
382 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  41.97 
 
 
375 aa  279  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 
375 aa  278  9e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  37.92 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  38.89 
 
 
394 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  38.34 
 
 
385 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  39.79 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  42.71 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  40.43 
 
 
367 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  38.87 
 
 
392 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 
374 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  39.12 
 
 
379 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  39.89 
 
 
391 aa  264  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  37.67 
 
 
394 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 
373 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
383 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 
380 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  41.11 
 
 
373 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  34.55 
 
 
380 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  38.8 
 
 
401 aa  255  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  36.98 
 
 
389 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  38.48 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  37.97 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>