More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5628 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  89.78 
 
 		 197 aa  329  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  85.86 
 
 		 196 aa  325  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  67.22 
 
 		 290 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  67.78 
 
 		 313 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  62.22 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  61.58 
 
 		 187 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  63.33 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  70 
 
 		 140 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  54.7 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  54.7 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  54.14 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  52.22 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  54.14 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  52.46 
 
 		 183 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  48.07 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  47.83 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  47.51 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  45.98 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  43.82 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  41.11 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  42.08 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.93 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.57 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40.44 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  39.67 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  42.7 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  42.7 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.42 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  42.39 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  39.46 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.56 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.56 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  44.2 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.34 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  38.76 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.66 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  39.89 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37.78 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  40.31 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.48 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  41.57 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  45.77 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.21 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  42.13 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  41.05 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.89 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.76 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.76 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  40.76 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.2 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  40.22 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  44.37 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  40.22 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  39.66 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.56 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  39.69 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.46 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  41.76 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.61 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.13 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  42.54 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  39.67 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>