297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5455 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 379 aa  742    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  80.69 
 
 		 379 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  80.69 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  83.66 
 
 		 361 aa  589  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  76.5 
 
 		 379 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  63.13 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  62.26 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  61.34 
 
 		 373 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  64.43 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  47.09 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  42.22 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  44.01 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  42.04 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  42.94 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  43.61 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  41.9 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  41.25 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  37.86 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  41.18 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  42.12 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  41.03 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  38.07 
 
 		 404 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  41.03 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  49.83 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  40.76 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  40.9 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  41.34 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  41.34 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40.7 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  41.64 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  40.51 
 
 		 382 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  41.03 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  39.36 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  41.44 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  35.23 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  35.5 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  38.27 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  35.68 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  34.58 
 
 		 449 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  34.59 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  35.9 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  38.39 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  36.34 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  36.74 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  36.31 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.44 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  35.4 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  33.43 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  44.29 
 
 		 238 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  37.22 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  32.74 
 
 		 404 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  43.33 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  42.92 
 
 		 231 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  35.78 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  38.82 
 
 		 180 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.68 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  36.84 
 
 		 164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  36.07 
 
 		 199 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  40.52 
 
 		 183 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  37.1 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  48.78 
 
 		 120 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.03 
 
 		 180 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  36.59 
 
 		 189 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  35.51 
 
 		 284 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  35.09 
 
 		 231 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  37.14 
 
 		 185 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  45.69 
 
 		 178 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  38.51 
 
 		 207 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  38.36 
 
 		 182 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  38.99 
 
 		 182 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  38.99 
 
 		 182 aa  92.8  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  38.99 
 
 		 182 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  38.99 
 
 		 182 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  38.99 
 
 		 182 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  37.74 
 
 		 182 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.97 
 
 		 190 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 		 182 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  37.11 
 
 		 182 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  37.11 
 
 		 182 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  32.02 
 
 		 240 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  29.63 
 
 		 184 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  37.66 
 
 		 190 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  36.9 
 
 		 175 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  40.83 
 
 		 167 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>