More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5447 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  74.09 
 
 		 316 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  73.72 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  67.58 
 
 		 463 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  69.53 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  67.27 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  67.15 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  74.8 
 
 		 329 aa  390  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  67.15 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  67.15 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  67.15 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  74.39 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  65.29 
 
 		 330 aa  377  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  75.42 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  75.42 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  64.95 
 
 		 330 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  65.4 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  65.28 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  65.28 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  64.6 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  64.6 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  60.84 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  58.46 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  57.84 
 
 		 320 aa  316  2e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  57.03 
 
 		 314 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  74.87 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  56.68 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  56.68 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  56.68 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  56.68 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  56.73 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  56.73 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  59.07 
 
 		 284 aa  292  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  56.64 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  59.21 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  72.84 
 
 		 221 aa  255  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  68.99 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  57.58 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  72.66 
 
 		 153 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  80.95 
 
 		 178 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  81.08 
 
 		 111 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  68.97 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  49.72 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  60.61 
 
 		 170 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  38.57 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  36.4 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  36.4 
 
 		 463 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  36.4 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.4 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  42.8 
 
 		 185 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  38.13 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  36.64 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  36.23 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  36.92 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  36.23 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  78.48 
 
 		 83 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  36.23 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  32.68 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  33.33 
 
 		 329 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  33.33 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  33.33 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  33.33 
 
 		 441 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  33.33 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  33.33 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  32.97 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  32.97 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  37.37 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  52.88 
 
 		 128 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  32.79 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 330 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1276  hypothetical protein  70.77 
 
 		 114 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  76.36 
 
 		 197 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  32.55 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  60.61 
 
 		 83 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  29.11 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  29.11 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  28.64 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 		 597 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  68 
 
 		 53 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4700  integrase, catalytic region  62.71 
 
 		 65 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  36.25 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  36.25 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  30.9 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  27.27 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>