114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5303 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5303  porin  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  74.25 
 
 		 299 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  57.79 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4552  porin  52.45 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  48.01 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4340  porin  51.74 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1819  hypothetical protein  31.61 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  40.33 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  28.15 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4795  outer membrane insertion C-terminal signal  32.28 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.814191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4110  hypothetical protein  28.71 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  38.12 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  28.72 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  32.23 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  26.45 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.67 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  30.29 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.83 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.64 
 
 		 661 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.56 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.08 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  26.13 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  24.2 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  28.69 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  30.35 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  27.18 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.09 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  27.46 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  27.94 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  24.17 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  26.92 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  27.4 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  29.59 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  29.86 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  27.86 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  28.47 
 
 		 703 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  27.05 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 447 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  27.24 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  29.15 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  22.83 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  29.15 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.81 
 
 		 1186 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  23.32 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  27.63 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  23.3 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  24.02 
 
 		 693 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.38 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  31.87 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  25.5 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  27.42 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  26.22 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.87 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30.49 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  24.55 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  24.55 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  32.99 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  25.29 
 
 		 689 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  28.01 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  24.49 
 
 		 662 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  25.26 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  26.56 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  24.69 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  32 
 
 		 453 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  27.08 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  25.53 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  26.07 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1972  Carbohydrate-selective porin OprB  33.56 
 
 		 703 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0983998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  27.64 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  25.44 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  24.32 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  28.57 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  29.41 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.29 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.71 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.11 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  29.87 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  31.03 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  24.36 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  27.13 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  28.22 
 
 		 670 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  25 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.46 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  25.89 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  32.28 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  32.28 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.63 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  24.8 
 
 		 570 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  29.87 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  26.01 
 
 		 566 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  32.22 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  24.5 
 
 		 665 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  32.22 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  27.88 
 
 		 577 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  28.22 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  28.85 
 
 		 724 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  28.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>