171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4907 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4907  porin  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  73.58 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  75.42 
 
 		 294 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  76.01 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  70.81 
 
 		 290 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  69.8 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  69.8 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  72.08 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  72.08 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  71.62 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  71.62 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  71.28 
 
 		 288 aa  331  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  69.13 
 
 		 287 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  70.95 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  71.96 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  68.69 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  64.35 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  63.96 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  64.43 
 
 		 277 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  61.41 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  60.33 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  60.33 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  62.96 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  61.79 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  63.04 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  59.11 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  58 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  55 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  48.84 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  45.95 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  43.41 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  41.23 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  41.23 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  39.23 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  39.23 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  40.67 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  40.48 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  44.34 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  42.3 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  42.32 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  35.62 
 
 		 583 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  35.1 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  39.92 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  35.53 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  42.18 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  35.42 
 
 		 571 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  35.81 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  42.02 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.93 
 
 		 207 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  34.8 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  35.33 
 
 		 453 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.42 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.56 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.36 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.74 
 
 		 240 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  34.9 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.43 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.5 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.75 
 
 		 452 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.71 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  40.27 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  35.59 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.89 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.29 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  29.64 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  32.12 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.21 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  31.65 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.58 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.96 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.89 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.63 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  30.96 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  33.79 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  32.14 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  34.84 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.98 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.4 
 
 		 710 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.94 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.66 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  29.05 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  36.06 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.43 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.22 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  30.9 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  29.06 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  36.6 
 
 		 997 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  37.82 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.35 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.35 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.22 
 
 		 692 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  34.38 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  34.35 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.78 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  29.45 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  34.72 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  29.41 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>