More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4896 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 
838 aa  670  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  47.01 
 
 
835 aa  670  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4432  ATPase domain-containing protein  98.94 
 
 
846 aa  1595  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.645763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0045  histidine kinase  46.31 
 
 
838 aa  689  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0624  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
837 aa  672  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0348163  normal  0.542065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0742  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.07 
 
 
862 aa  1073  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
842 aa  1671  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.9 
 
 
830 aa  1051  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  45.52 
 
 
903 aa  677  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  93 
 
 
857 aa  1567  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485802  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
859 aa  715  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
843 aa  671  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
837 aa  665  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0207  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
837 aa  676  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.46 
 
 
830 aa  1057  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3577  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
843 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2016  putative sensory box histidine kinase  41.66 
 
 
837 aa  576  1e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.377194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3963  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
861 aa  577  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2099  sensory box histidine kinase, putative  41.66 
 
 
859 aa  576  1e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0821  histidine kinase  42.41 
 
 
858 aa  577  1e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  41.01 
 
 
826 aa  573  1e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4290  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
861 aa  574  1e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731111  normal  0.889005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
861 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235165  normal  0.571653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  39.14 
 
 
911 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3296  histidine kinase  49.32 
 
 
837 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.584314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1354  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
824 aa  477  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
829 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
782 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0262543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
801 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
770 aa  356  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
798 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
787 aa  317  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.842242  normal  0.67921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
844 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
774 aa  168  3e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
784 aa  168  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
617 aa  166  1e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
582 aa  166  1e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
856 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  36.36 
 
 
617 aa  164  8e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
1352 aa  164  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
523 aa  164  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
646 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  31.88 
 
 
783 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
772 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  31.88 
 
 
783 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  28.61 
 
 
771 aa  163  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
775 aa  163  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
456 aa  162  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
568 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  39.48 
 
 
508 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
779 aa  160  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
1029 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
587 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1274 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
442 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
605 aa  158  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
442 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
646 aa  158  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
389 aa  157  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  36.17 
 
 
603 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
905 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
687 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0768  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
383 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  35.14 
 
 
576 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  37.15 
 
 
729 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
911 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
833 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
775 aa  155  3e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
562 aa  155  3e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
885 aa  155  3e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  41.77 
 
 
648 aa  155  3e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  33.75 
 
 
908 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
643 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  30.62 
 
 
774 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  31.36 
 
 
771 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
1271 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
911 aa  154  9e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
851 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.53 
 
 
1046 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  30.06 
 
 
843 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  34.48 
 
 
828 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.13 
 
 
565 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
509 aa  153  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
657 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  35.17 
 
 
716 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
691 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  38.75 
 
 
845 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  40.68 
 
 
525 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
769 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
798 aa  151  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
763 aa  151  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
610 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
770 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
738 aa  150  1e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
627 aa  150  1e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
1194 aa  149  1e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
940 aa  150  1e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
614 aa  150  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
906 aa  149  2e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
484 aa  149  2e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>