282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4697 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
328 aa  646  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  97.87 
 
 
328 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  79.71 
 
 
283 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.3 
 
 
257 aa  262  7e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.94 
 
 
279 aa  251  9e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.66 
 
 
242 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51 
 
 
266 aa  245  7e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.58 
 
 
837 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  50.2 
 
 
245 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.42 
 
 
242 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.02 
 
 
242 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.15 
 
 
246 aa  220  2e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.94 
 
 
246 aa  216  3e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44 
 
 
808 aa  184  2e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.98 
 
 
249 aa  162  8e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 
260 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 
249 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.3 
 
 
282 aa  134  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.89 
 
 
261 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.89 
 
 
261 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
244 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
287 aa  120  4e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.11 
 
 
259 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 
269 aa  115  9e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 
226 aa  115  1e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 
269 aa  115  1e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.74 
 
 
250 aa  110  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.06 
 
 
271 aa  111  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.01 
 
 
228 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
271 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
263 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
263 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
264 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.24 
 
 
258 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
258 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
246 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.63 
 
 
232 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 
266 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 
278 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
285 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.92 
 
 
285 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
265 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.34 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.47 
 
 
285 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
236 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  35.34 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.6 
 
 
1153 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.77 
 
 
247 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.07 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  34.59 
 
 
286 aa  92.8  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
244 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  34.25 
 
 
277 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  29.8 
 
 
244 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
243 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 
240 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
233 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.54 
 
 
240 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.57 
 
 
286 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
312 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
265 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.83 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
278 aa  85.1  1e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 
673 aa  85.5  1e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
231 aa  85.9  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 
282 aa  85.5  1e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
231 aa  85.5  1e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
245 aa  85.1  2e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
284 aa  80.1  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
253 aa  80.1  4e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  31.46 
 
 
292 aa  80.1  5e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.53 
 
 
284 aa  79.7  6e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.53 
 
 
284 aa  79.7  6e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.53 
 
 
300 aa  79.7  7e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
284 aa  77  4e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.21 
 
 
235 aa  75.1  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  31.27 
 
 
316 aa  74.7  2e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
286 aa  74.7  2e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
269 aa  75.1  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
576 aa  73.9  3e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
249 aa  74.3  3e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 
284 aa  73.6  4e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
277 aa  73.6  5e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
230 aa  73.2  6e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
236 aa  73.2  7e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 
292 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 
284 aa  70.5  3e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
253 aa  70.5  4e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 
276 aa  70.5  4e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.16 
 
 
263 aa  70.1  5e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.36 
 
 
290 aa  69.7  6e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>