More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4668 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 161 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  95.03 
 
 		 165 aa  295  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  88.08 
 
 		 159 aa  261  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  75.35 
 
 		 167 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 149 aa  94  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  39.44 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.25 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.25 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  42.25 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.48 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.67 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  33.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  33.61 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  41.51 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.97 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.77 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.77 
 
 		 473 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.15 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.15 
 
 		 346 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  55.32 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  46.3 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  43.94 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.96 
 
 		 345 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>