More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4471 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  99.55 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  93.64 
 
 		 220 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 212 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  69.23 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 210 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.8 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  38 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  29.95 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.82 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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