76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4453 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  89.73 
 
 		 448 aa  822    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  100 
 
 		 448 aa  913    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  100 
 
 		 448 aa  913    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.69 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  49.33 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  48.88 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  33.99 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  33.99 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  33.53 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.61 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.55 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  31.78 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.21 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  32.18 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  34.72 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  31.05 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.44 
 
 		 394 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.16 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  33.92 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.9 
 
 		 414 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  32.73 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.47 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.55 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  32.17 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  32.15 
 
 		 611 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.61 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  28 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  28 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  30.79 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.34 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  27.25 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.93 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  27.57 
 
 		 515 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  27.57 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  27.57 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  27.57 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  27.57 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  26.89 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  27.57 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 369 aa  126  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  27.12 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  24.43 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  25.42 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  24.59 
 
 		 391 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  25.14 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  25.14 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  23.85 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  23.85 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  28.18 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  25.81 
 
 		 380 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.78 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  24.86 
 
 		 569 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.56 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  23.01 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  28.3 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  26.42 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  26.2 
 
 		 388 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  24.23 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  28.37 
 
 		 652 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  28.37 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  24.64 
 
 		 579 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  25.98 
 
 		 590 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 373 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  23.1 
 
 		 372 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  27.03 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  25.76 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  24.66 
 
 		 585 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  25.99 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  23.39 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  21.17 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.71 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>