More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4369 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  830    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  97.81 
 
 
412 aa  812    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  95.86 
 
 
411 aa  800    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  65.94 
 
 
413 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  65.46 
 
 
417 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  62.32 
 
 
413 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  61.24 
 
 
417 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  61.02 
 
 
468 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  52.98 
 
 
418 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  49.54 
 
 
442 aa  388  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  42.49 
 
 
421 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.3 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.7 
 
 
402 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.29 
 
 
405 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.62 
 
 
429 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.32 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.5 
 
 
419 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.97 
 
 
411 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.46 
 
 
398 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.83 
 
 
405 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.57 
 
 
420 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.35 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.68 
 
 
427 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.36 
 
 
409 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.89 
 
 
416 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.35 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.06 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.23 
 
 
411 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  41.36 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.69 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.78 
 
 
410 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.94 
 
 
399 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.98 
 
 
407 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.96 
 
 
412 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  42.12 
 
 
411 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.22 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.97 
 
 
411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.73 
 
 
411 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  42.86 
 
 
411 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.73 
 
 
411 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.58 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.44 
 
 
411 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  42.86 
 
 
411 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.46 
 
 
411 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.46 
 
 
411 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.19 
 
 
411 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.88 
 
 
423 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.11 
 
 
417 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.39 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.38 
 
 
406 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.38 
 
 
411 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.97 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.17 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.46 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.71 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.8 
 
 
410 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.48 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.26 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.71 
 
 
417 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.54 
 
 
423 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  35.94 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.75 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.49 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  37.83 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  33.85 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.22 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  35.41 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.58 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.66 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.83 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.24 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.98 
 
 
422 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.1 
 
 
417 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.27 
 
 
406 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.38 
 
 
400 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  34.38 
 
 
404 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.66 
 
 
402 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.3 
 
 
405 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.56 
 
 
394 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.65 
 
 
412 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.16 
 
 
405 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  33.9 
 
 
400 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  36.8 
 
 
464 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.5 
 
 
436 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.41 
 
 
402 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  35.68 
 
 
417 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  40.46 
 
 
419 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.66 
 
 
409 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  34.24 
 
 
418 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  35.82 
 
 
414 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  31.94 
 
 
422 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  35.34 
 
 
430 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.31 
 
 
390 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  32.23 
 
 
396 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  34.45 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.1 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.29 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>