88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4323 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  99.78 
 
 
463 aa  901    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  100 
 
 
463 aa  902    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  96.11 
 
 
463 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  71.49 
 
 
463 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  68.39 
 
 
465 aa  630  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  65.67 
 
 
466 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  66.88 
 
 
466 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  68.59 
 
 
466 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  66.67 
 
 
466 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  67.95 
 
 
466 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  67.31 
 
 
463 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  67.39 
 
 
463 aa  591  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  67.1 
 
 
463 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  65.44 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  68.38 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  66.29 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  66.29 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  68.38 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  68.16 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  66.07 
 
 
463 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  67.63 
 
 
463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  68.16 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  68.16 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  67.52 
 
 
467 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  67.31 
 
 
495 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  65.85 
 
 
463 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  66.03 
 
 
463 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  66.96 
 
 
466 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  67.19 
 
 
463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  65.81 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  67.96 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  67.52 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  65.67 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  65.88 
 
 
466 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  67.31 
 
 
467 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  67.1 
 
 
463 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  57.72 
 
 
465 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  58.21 
 
 
479 aa  501  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  56.62 
 
 
478 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  56.47 
 
 
478 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  55.72 
 
 
479 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  56.34 
 
 
479 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  55.51 
 
 
479 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  55.72 
 
 
479 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  55.51 
 
 
479 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  55.32 
 
 
479 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  55.93 
 
 
479 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  54.6 
 
 
479 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  56.41 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  55.98 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  46.9 
 
 
464 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  45.45 
 
 
462 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  45.87 
 
 
469 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  48.45 
 
 
461 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  44.35 
 
 
471 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  44.67 
 
 
471 aa  333  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  45.61 
 
 
481 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  46.78 
 
 
463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  43.43 
 
 
521 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  46.05 
 
 
469 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  40.05 
 
 
459 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  39.81 
 
 
459 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  41.63 
 
 
489 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  44.57 
 
 
469 aa  296  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  42.51 
 
 
452 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  43.29 
 
 
485 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  38.51 
 
 
487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  40.69 
 
 
483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  40.48 
 
 
491 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  39.32 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  34.81 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  34.33 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  33.49 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  36.63 
 
 
457 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  43.06 
 
 
479 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  46.84 
 
 
484 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  66.36 
 
 
141 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  66.36 
 
 
141 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  66.36 
 
 
141 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  66.36 
 
 
141 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0560  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  36.96 
 
 
625 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1691  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.67 
 
 
565 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>