79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4268 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 
150 aa  296  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  96.67 
 
 
150 aa  265  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  92 
 
 
150 aa  247  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  79.59 
 
 
147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  71.92 
 
 
147 aa  186  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  70.55 
 
 
147 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  47.22 
 
 
167 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  49.33 
 
 
143 aa  123  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  52.24 
 
 
151 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  49.64 
 
 
166 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  48.25 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  48.25 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  46.85 
 
 
153 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  43.97 
 
 
153 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  45.8 
 
 
154 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  45.77 
 
 
148 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  43.51 
 
 
155 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  43.51 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  39.69 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  45.26 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  37.98 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  31.34 
 
 
298 aa  77.4  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  32.87 
 
 
284 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  36.05 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  38.03 
 
 
224 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  35.2 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  37.76 
 
 
294 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  36.76 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  30.26 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  40.41 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  31.25 
 
 
186 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  35.71 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  31.76 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  27.89 
 
 
177 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  31.33 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  30.67 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  37.1 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  32.89 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  35.33 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  31.65 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  29.8 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  29.8 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  26.53 
 
 
178 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  24.65 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  28.57 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  33.76 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  30.56 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  29.25 
 
 
198 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  32.64 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  28.29 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  34.29 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  32.33 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  35.11 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  33.55 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  25.66 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  31.03 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  32.03 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  28.76 
 
 
195 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  34.21 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  26.35 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  29.58 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  29.63 
 
 
183 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  29.37 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  29.63 
 
 
183 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  28.68 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  31.37 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  30.37 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  24.43 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  21.77 
 
 
204 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  32.06 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  20.41 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  24.49 
 
 
208 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>