56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4257 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
259 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  99.23 
 
 
259 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  55 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  45.14 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  46.77 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  46.72 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  37.25 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  36.18 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  35.29 
 
 
244 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  35.63 
 
 
254 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  35.83 
 
 
243 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  35.83 
 
 
243 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  32.48 
 
 
294 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  35.94 
 
 
302 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  38.37 
 
 
234 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  35.43 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  34.88 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  32.88 
 
 
315 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  32.57 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  33.08 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  32.52 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  35.1 
 
 
234 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  30.08 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  35.52 
 
 
230 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  28.81 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  30.04 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  31.03 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  28.46 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  31.09 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  26.79 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  31.08 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  30.77 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  29.72 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  30.89 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  30.04 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  27.64 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  31.4 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  29.44 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  30.08 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  27.64 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  31.45 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  30.86 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  30.86 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  29.53 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  28.52 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  27.49 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  29.96 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  47.22 
 
 
227 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  31.8 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  45.59 
 
 
696 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  25.73 
 
 
234 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  27.34 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  40.58 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>