More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4168 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  99.35 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  100 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  92.96 
 
 		 317 aa  530  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  72.99 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  69.85 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  67.52 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  49.5 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  50.18 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  49.82 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  47.16 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  44.89 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  45.79 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  46.77 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  46.27 
 
 		 271 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  48.39 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.67 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  47.97 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  45.68 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  44.96 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  43.33 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  48.09 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.57 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  42.48 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  39.73 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  41.7 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  38.76 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  36.12 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  39.78 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  36.23 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  32.11 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  32.41 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  31.73 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  33.46 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  33.72 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  31.27 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  31.5 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  29.93 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  32.3 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  29.88 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  32.31 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  26.58 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  27.65 
 
 		 409 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  32.24 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  33.6 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.33 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  31.54 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  30.32 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  32.08 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 396 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.85 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  28.39 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  27.3 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  27.3 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  28.03 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  34.4 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  33.46 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  33.46 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  25.76 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  33.46 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  31.08 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  31.42 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  27.6 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  32.81 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  29.53 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  31.5 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.6 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  30.25 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  30.25 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  28.11 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  31.33 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  31.87 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.07 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.33 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  31.64 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  31.25 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  30.55 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  27.72 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.14 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  30.26 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  29.18 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2211  aldo/keto reductase  35.54 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684458  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  26.96 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  29.53 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  29.69 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  28 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  28.71 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  27.13 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>