More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3979 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 360 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  45.32 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  40.75 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  46.22 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 		 353 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  43.77 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  40.52 
 
 		 348 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  43.6 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  41 
 
 		 352 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  41.13 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  41.43 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  41.43 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  39.54 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  40.75 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  40.75 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  40.75 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  41.62 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  39.83 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.93 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  41.69 
 
 		 351 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  38.15 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  40.24 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  42.37 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  34.69 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  39.39 
 
 		 476 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  34.11 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.32 
 
 		 353 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  34.77 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.63 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  40.43 
 
 		 238 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  39.19 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 238 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  35.02 
 
 		 238 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 229 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 820 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 		 828 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 784 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.27 
 
 		 784 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.27 
 
 		 784 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 784 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 784 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  35.96 
 
 		 832 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 843 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.84 
 
 		 828 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 784 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 784 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 816 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 237 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 833 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.38 
 
 		 784 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.38 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  34.32 
 
 		 820 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.47 
 
 		 827 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 784 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  33.79 
 
 		 818 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 830 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 834 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 		 827 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 854 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 810 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.22 
 
 		 818 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 		 843 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 830 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.22 
 
 		 828 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 841 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 785 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.51 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 821 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 835 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 832 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 835 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.97 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 240 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 832 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 835 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 836 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 243 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.16 
 
 		 842 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 836 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 840 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.57 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 833 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.48 
 
 		 712 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 		 842 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  35.15 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.77 
 
 		 836 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 835 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.05 
 
 		 842 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>