More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3974 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
520 aa  1024    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.56 
 
 
518 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.99 
 
 
518 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  54.99 
 
 
518 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  60.3 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  66.04 
 
 
225 aa  283  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.17 
 
 
545 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.17 
 
 
545 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.17 
 
 
545 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.02 
 
 
546 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.02 
 
 
546 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.77 
 
 
549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.97 
 
 
509 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.76 
 
 
536 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  30.86 
 
 
539 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  40.34 
 
 
361 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.46 
 
 
570 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.85 
 
 
487 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 
501 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.15 
 
 
562 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.76 
 
 
511 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  43.1 
 
 
344 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  66.38 
 
 
118 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.85 
 
 
353 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.33 
 
 
441 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  45.45 
 
 
229 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.47 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.76 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.4 
 
 
297 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  30.77 
 
 
327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  40.61 
 
 
284 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3937  hypothetical protein  52.04 
 
 
124 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2277  hypothetical protein  45.3 
 
 
216 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.717235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  38.66 
 
 
122 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0739  hypothetical protein  45.79 
 
 
188 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4147  hypothetical protein  52.81 
 
 
121 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530986  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  27.67 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  25.37 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  25.37 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  25.37 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  25.37 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0633  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  30.89 
 
 
157 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.283421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  27.31 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  27.31 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  27.31 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.55 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2875  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  21.74 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
391 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.76 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.46 
 
 
391 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  28.87 
 
 
237 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  27.16 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  27.16 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  27.31 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0916  ISBma1, transposase  27.59 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  27.59 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  27.59 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  27.59 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  27.16 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  27.16 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1230  ISBma1, transposase, interruption-N  27.16 
 
 
255 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2438  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  27.16 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1439  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  45.83 
 
 
83 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  26.89 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>