More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3624 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  97.49 
 
 
319 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  88.6 
 
 
310 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  67.73 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.85 
 
 
311 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
361 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
304 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
314 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
307 aa  205  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
298 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
311 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
310 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
324 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
312 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
298 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
336 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
324 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.94 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
318 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
324 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.75 
 
 
652 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
293 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.84 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.99 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
714 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
308 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.2 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
306 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
1739 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
299 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
1162 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
318 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
312 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
679 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
691 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  31.9 
 
 
279 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
308 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
705 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
616 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.65 
 
 
2401 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
691 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
525 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
290 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
624 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
274 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
333 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
318 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
387 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  39.74 
 
 
1837 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  29.17 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
360 aa  99.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0688  glycosyl transferase protein  33.33 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
691 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
822 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
841 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
703 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
836 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
282 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  29.18 
 
 
907 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
401 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
1077 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
341 aa  92.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
276 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
276 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>