More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3424 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  97.9 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  93.36 
 
 		 286 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  76.34 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  70.38 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  65.51 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  55.44 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  58.25 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  57.34 
 
 		 295 aa  291  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  54.06 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  56.4 
 
 		 292 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  52.41 
 
 		 290 aa  281  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  52.36 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  54.09 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  52.36 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  55.67 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  52.08 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  56.43 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  51.04 
 
 		 286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  52.28 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  54.29 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  56.03 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  49.12 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  48.78 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  54.61 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  51.61 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  49.82 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  51.48 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  51.28 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  49.1 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  49.44 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  48.75 
 
 		 265 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  46.95 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  52.21 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  49.77 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.26 
 
 		 350 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  45.5 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.5 
 
 		 326 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  42.47 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  42.01 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.46 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  42.2 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  44.6 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.96 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  43.78 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.19 
 
 		 357 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  43.04 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  43.46 
 
 		 364 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  40.73 
 
 		 316 aa  158  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  42.52 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  45.08 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  43.14 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  43.2 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  40.91 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.19 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2055  peptidase S49  45.56 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  46.15 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  41.71 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.52 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.45 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  41.12 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  48.11 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  42.65 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  38.91 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  42.63 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1966  peptidase S49  44.17 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  44.12 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  41.75 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  40.81 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  42.16 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  42.16 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  42.16 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  41.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  41.75 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  37.85 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  40.78 
 
 		 360 aa  148  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  41.23 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  40.2 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  42.23 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  42.18 
 
 		 330 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  41.23 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  40.78 
 
 		 387 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  39.81 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  36.11 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  39.81 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  40.95 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  43.41 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  42.93 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  38.81 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  42.11 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>