18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3387 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  95.35 
 
 		 86 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  80.49 
 
 		 85 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  78.31 
 
 		 86 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  48.81 
 
 		 82 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3378  hypothetical protein  67.27 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  39.08 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  39.24 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  40.96 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  38.75 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  34.18 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  38.55 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  35.44 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  34.18 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>