44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3231 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 328 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  96.65 
 
 		 328 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  87.62 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  64.54 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  58.86 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  42.19 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  39.75 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  41.43 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  40.52 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  41.44 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  40.54 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  35.98 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  43.15 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  35.22 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  40.17 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  34.57 
 
 		 258 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  35.18 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  35.34 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  33.86 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  34.87 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  33.62 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  34.89 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  34.45 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  35.42 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  34.16 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  33.73 
 
 		 245 aa  96.7  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  68.6 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  29.58 
 
 		 254 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  23.92 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  23.85 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  32.66 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  33.99 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.43 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.6 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  30.67 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  28.12 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  23.72 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  24.24 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  32.36 
 
 		 263 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  29.84 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25.9 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  27 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>