20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3171 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3171  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00924455  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2944  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6628  hypothetical protein  56.25 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4743  plasmid stabilization system  49.25 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.786175  normal  0.0196612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2000  hypothetical protein  44.78 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2268  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0985  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  44 
 
 		 697 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1787  hypothetical protein  40.58 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3073  plasmid stabilization system protein  58.14 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2431  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  44 
 
 		 710 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3025  hypothetical protein  35.82 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  37.31 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0782  plasmid stabilization system  40.58 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00543713  normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.43 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2099  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1817  addiction module antitoxin  34.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0467735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2275  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.39 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3697  plasmid stabilization system  39.39 
 
 		 81 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.967290000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4161  plasmid stabilization system  43.18 
 
 		 88 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>